数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2菌株的行为实验数据,由Schafer实验室于2010年10月15日采集。数据记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为表现,包含视频跟踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,支持线虫行为学分析。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:N2 on food R_2010_10_15__15_34310.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频跟踪原始数据,记录线虫行为的时空信息
- 特征提取文件
- 文件名称:N2 on food R_2010_10_15__15_34310_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储行为特征提取结果,如运动轨迹、速度等参数
- 标准化格式文件
- 文件名称:N2 on food R_2010_10_15__15_34310.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为线虫行为数据的标准化格式文件,便于跨平台分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究: 分析N2菌株在特定培养基和食物条件下的运动模式、行为节律等特征
- 神经生物学实验验证: 结合实验条件(如30分钟适应期),研究环境因素对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 行为特征提取算法评估: 基于特征文件验证tierpsy软件提取的行为参数准确性
- 模式生物数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化实验数据,支持同类研究对比分析