数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了DA1814菌株(基因型ser-1(ok345)X)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂平板上开展,使用tierpsy软件追踪分析,包含原始数据、特征数据及标准化格式数据,可用于研究ser-1基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:ser-1 (ok345) on food R_2009_12_14__10_41_3323.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射:包含线虫行为追踪的原始数据,记录实验过程中线虫的运动轨迹等基础信息
- 文件名称:ser-1 (ok345) on food R_2009_12_14__10_41_3323_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射:包含线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取的运动特征参数
- 文件名称:ser-1 (ok345) on food R_2009_12_14__10_41_3323.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射:包含标准化的线虫行为数据,符合wcon数据交换格式要求
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析ser-1基因缺失(ok345突变)对线虫运动行为的影响
- 神经生物学实验: 探究血清素受体基因ser-1在秀丽隐杆线虫行为调控中的作用机制
- 行为学数据分析方法验证: 基于标准化实验方案和tierpsy软件输出,验证线虫行为特征提取算法
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供特定基因型的实验数据支撑