数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)CB755品系(携带unc-43(e755)IV基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征,包含视频追踪数据及衍生的行为特征数据,支持线虫基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 文件1:
unc-43 (e755)IV on food L_2010_09_16__12_27_59__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为视频的原始追踪数据,可能涉及帧级别的位置、骨架坐标等基础运动信息
- 文件2:
unc-43 (e755)IV on food L_2010_09_16__12_27_59__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析生成,可能涉及运动速度、身体弯曲度、摄食频率等衍生特征
- 文件3:
unc-43 (e755)IV on food L_2010_09_16__12_27_59__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,可能包含标准化的运动轨迹与行为事件记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变体行为表型分析:研究unc-43(e755)IV基因突变对秀丽隐杆线虫运动、摄食等行为的影响
- 神经生物学研究:探索unc-43基因在调控线虫神经肌肉系统及行为中的功能机制
- 模式生物行为学实验方法验证:基于标准化实验方案(Yemini et al.方法),验证线虫行为实验的可重复性
- 行为特征提取算法评估:利用已知基因突变体的行为数据,测试tierpsy等追踪软件的特征提取准确性