数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC1340品系(携带C52B9.11基因gk596等位突变)成年雌雄同体线虫在特定实验条件下的行为实验数据,包含视频追踪结果及特征提取文件,用于研究该基因相关的行为表型。
文件详解
- 文件名称:
C52B9.11 (gk596)V on food R_2011_09_13__12_19___3___4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含线虫行为轨迹的标准格式数据(基于wcon规范),记录线虫运动的时空坐标等基础行为信息
- 文件名称:
C52B9.11 (gk596)V on food R_2011_09_13__12_19___3___4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度、摆尾频率等结构化特征
- 文件名称:
C52B9.11 (gk596)V on food R_2011_09_13__12_19___3___4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:可能存储实验原始追踪数据或中间处理结果,包含视频帧对应的线虫形态、位置等详细信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析C52B9.11基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 行为表型分析: 基于特征数据研究突变线虫的运动模式、觅食行为等表型差异
- 生物行为追踪算法验证: 利用标注的行为数据评估线虫行为追踪软件的准确性
- 神经生物学机制研究: 结合基因背景探索线虫行为背后的神经调控机制