数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC2324品系(flp-6(ok3056)V基因突变体)成虫在特定环境下的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,包含视频追踪及行为特征分析结果,可用于研究flp-6基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:flp-6 (ok3056)V on food R_2010_01_14__11_35_2664.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件,格式遵循wcon标准(线虫行为数据交换格式)
- 文件名称:flp-6 (ok3056)V on food R_2010_01_14__11_35_2664_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
- 文件名称:flp-6 (ok3056)V on food R_2010_01_14__11_35_2664.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始追踪数据,涉及线虫骨架分割(共18005个分割骨架)、时间参数(总时长898.596秒,帧率25.5754帧/秒)、空间参数(视频像素对应4.64514微米)等基础信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析flp-6基因突变体与野生型线虫的行为差异,探究该基因对行为的调控机制
- 生物行为特征分析:基于tierpsy提取的特征数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为等
- 行为实验方法验证:参考实验 protocol(E. Yemini et al.方法),为同类线虫行为实验提供方法学参考
- 模式生物数据库补充:作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持线虫行为组学的整合研究