数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC975品系(携带tag-336基因ok1477等位突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年4月8日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为记录,涉及实验条件、视频参数及分析结果文件,总计3个文件。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:
tag-336 (ok1477) on food L_2010_04_08__12_03_11___1___3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含线虫行为的原始或标准化记录数据(基于wcon格式,通常用于存储线虫行为轨迹信息)
- 特征数据文件
- 文件名称:
tag-336 (ok1477) on food L_2010_04_08__12_03_11___1___3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,可能包含运动轨迹、身体姿态等特征参数
- 主数据文件
- 文件名称:
tag-336 (ok1477) on food L_2010_04_08__12_03_11___1___3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的核心数据,可能涵盖视频帧信息、线虫分割骨架数据(共19258个)及行为分析结果
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析tag-336基因ok1477突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 线虫行为学分析:基于视频参数和特征数据,研究线虫在特定培养基上的运动模式与行为规律
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用:评估tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为特征提取中的性能与应用价值