数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了JR2370品系(携带egl-18(ok290)IV基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,通过视频跟踪获取线虫运动特征,包含原始跟踪数据、特征数据及标准化格式数据,共3个文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
egl-18 (ok290)IV on food R_2010_07_20__11_27_01___7___3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始跟踪数据,如分段骨架信息等基础运动记录
- 特征数据文件
- 文件名称:
egl-18 (ok290)IV on food R_2010_07_20__11_27_01___7___3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析生成
- 标准化格式文件
- 文件名称:
egl-18 (ok290)IV on food R_2010_07_20__11_27_01___7___3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:以wcon标准化格式存储的线虫行为数据压缩包
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-18基因对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为学特征提取:基于视频跟踪数据挖掘线虫运动模式、速度等行为参数
- 基因与行为关联分析:探究基因突变与线虫摄食、移动等行为表型的关系
- 模式生物实验方法验证:验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为实验中的应用效果