数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AQ495菌株(gpa-14(pk347)I基因突变体)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的运动行为,包含视频追踪数据及特征提取结果,是研究gpa-14基因功能与线虫行为关系的基础数据。
文件详解
- 文件名称:gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__14_25__15.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始或标准化数据压缩包
- 文件名称:gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__14_25__15_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
- 文件名称:gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__14_25__15.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动的骨架分割数据(共6349个分割骨架)、时间参数(总时长299.322秒,帧率31.9489帧/秒)、空间参数(视频像素对应4.95268微米)等实验基础数据
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-14基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学实验验证: 验证gpa-14基因在调控线虫行为中的作用机制
- 模式生物行为学分析: 基于标准化行为数据开展线虫行为模式的定量研究
- 基因与行为关联分析: 探索gpa-14基因表达与线虫摄食、运动等行为的关联性
- 生物信息学算法测试: 用于tierpsy等线虫行为追踪软件的算法验证与优化