数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1816品系(基因型gpa-16(ok2349)I)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基上进行,包含视频及特征分析结果,可用于研究gpa-16基因对秀丽隐杆线虫行为表型的影响。
文件详解
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-16 (ok2349)I on food R_2009_07_13__12_47_12__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取生成
- 主数据文件
- 文件名称:gpa-16 (ok2349)I on food R_2009_07_13__12_47_12__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:实验核心数据文件,存储线虫行为观测的原始或处理后数据
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:gpa-16 (ok2349)I on food R_2009_07_13__12_47_12__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件,格式为wcon(线虫行为数据标准格式)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析gpa-16基因对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食行为等表型的调控作用
- 行为表型组学分析: 结合特征数据研究线虫行为的量化指标与基因功能的关联
- 基因功能验证: 验证gpa-16基因在神经信号传导或行为调控中的具体功能
- 实验方法复现: 参考实验方案(基于E. Yemini等的方法)开展同类线虫行为实验