数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了NL1137品系(携带gpa-5(pk376)X突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,包含视频记录及处理后的行为特征数据,可用于研究gpa-5基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food R_2009_06_24__15_07_49__24.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件,推测存储标准化行为记录格式(wcon)的原始或结构化行为数据
- HDF5行为数据文件
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food R_2009_06_24__15_07_49__24.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,可能包含视频帧对应的线虫位置、运动轨迹等基础行为信息
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-5 (pk376)X on food R_2009_06_24__15_07_49__24_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,基于6493个分割骨架生成,包含运动速度、身体弯曲度等行为特征指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gpa-5(pk376)X突变对秀丽隐杆线虫觅食、运动等行为的影响
- 行为学实验方法验证:基于Yemini等人的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 行为特征提取算法评估:以tierpsy软件处理的特征数据为基础,评估线虫行为特征提取算法的性能
- 神经生物学机制研究:结合基因背景与行为数据,探究gpa-5基因参与的神经调控通路