数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了NL1137品系(基因型gpa-5(pk376)X)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据。包含实验基本信息、视频分析参数及处理后的行为特征文件,可用于研究gpa-5基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:
gpa-5 (pk376)X on food R_2010_03_09__12_04_16___1___5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始或标准化数据,具体字段需解压后查看wcon格式内容
- 主数据文件
- 文件名称:
gpa-5 (pk376)X on food R_2010_03_09__12_04_16___1___5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,可能包含视频帧、骨架数据等原始或中间处理结果
- 特征数据文件
- 文件名称:
gpa-5 (pk376)X on food R_2010_03_09__12_04_16___1___5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如运动轨迹、身体姿态等量化指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-5基因对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食行为等的调控作用
- 行为表型分析: 基于提取的行为特征,研究基因突变线虫的表型差异
- 实验方法验证: 参考实验方案(E. Yemini等的方法)开展同类线虫行为实验的方法学验证
- 生物信息学分析: 利用HDF5格式的特征数据,进行线虫行为的量化建模与数据分析