数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1380品系(携带C11D2.2基因ok1565突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含线虫运动特征等数据,可用于基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 特征数据文件:C11D2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_31__16_10310_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动相关特征(如骨架坐标、速度等)
- 行为数据文件:C11D2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_31__16_10310.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含21494个分段骨架数据,对应898.1秒实验时长、24.04帧/秒的采样频率
- 压缩数据文件:C11D2.2 (ok1565)IV on food R_2011_08_31__16_10310.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,格式遵循wcon标准,包含实验过程中线虫的运动轨迹与行为参数
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 基因功能研究:分析C11D2.2基因敲除对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 线虫行为学分析:研究成年雌雄同体线虫在食物环境中的运动模式与行为特征
- 行为数据库补充:作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为数据整合分析
- 软件验证与优化:用于tierpsy行为追踪软件的性能验证或算法优化
- 基因-行为关联分析:构建基因功能与行为表型的关联模型,探索神经生物学机制