数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫JT603品系(gpb-2(sa603)I)的行为实验数据,属于C.elegans behavioural database的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于线虫基因功能与行为关联的研究。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2010_03_05__12_33_57210.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,如运动轨迹、骨架分割信息等
- 特征数据文件
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2010_03_05__12_33_57210_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度等量化指标
- 标准化格式文件
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2010_03_05__12_33_57210.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩包,用于跨平台的线虫行为数据交换
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析gpb-2基因对秀丽隐杆线虫行为的调控机制
- 行为生物学分析: 研究线虫在特定环境下的运动模式、觅食行为等特征
- 基因功能验证: 验证gpb-2基因突变体与野生型线虫的行为差异
- 生物信息学建模: 基于行为特征数据构建线虫行为预测模型
- 实验方法标准化: 参考Tierpsy追踪系统的实验流程与数据格式规范