数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了LX982品系(携带ocr-1、ocr-2、ocr-4基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年3月26日开展,包含线虫在特定培养基上的运动行为记录,以及对应的特征提取和格式转换文件,可用于研究基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 主数据文件:
ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food R_2010_03_26__12_36_43___2___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始记录数据,包含视频帧对应的线虫运动轨迹、骨架信息等基础行为数据
- 特征文件:
ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food R_2010_03_26__12_36_43___2___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储从原始数据中提取的线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度等量化指标
- 格式转换文件:
ocr-4 (vs137); ocr-2 (9447); ocr-1 (ok134) on food R_2010_03_26__12_36_43___2___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩包,用于不同分析平台间的数据兼容转换
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变功能研究: 分析ocr基因家族突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学行为分析: 基于线虫骨架和运动特征数据,研究其神经调控机制
- 模式生物行为实验方法验证: 参考实验方案(E. Yemini等方法),验证行为学实验的标准化流程
- 生物信息学特征提取工具评估: 基于tierpsy软件提取的特征数据,评估行为特征提取算法的有效性