数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了Schafer Lab开展的N2菌株(Bristol, UK)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年5月13日进行,涵盖线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征,包含视频追踪数据及特征提取结果,总计3个文件。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:N2 on food L_2010_05_13__10_15_45__1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始或标准化数据文件,具体内容需解压后查看
- 主数据文件
- 文件名称:N2 on food L_2010_05_13__10_15_45__1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,可能包含视频帧、骨架 segmentation 等原始追踪信息
- 特征数据文件
- 文件名称:N2 on food L_2010_05_13__10_15_45__1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从行为数据中提取的特征信息,对应实验中记录的18948个分段骨架等特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为模式研究:分析N2菌株成年线虫在食物环境中的运动轨迹、行为节律等特征
- 神经生物学实验验证:基于标准化行为数据,验证线虫神经机制与行为表现的关联
- 实验方法复现:参考E. Yemini等人的实验方法,复现或优化线虫行为学实验设计
- 行为特征提取算法测试:利用已知行为数据,测试或改进tierpsy等行为追踪软件的特征提取精度