数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2菌株的行为实验数据,来自Schafer实验室。实验记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂环境中的行为,包含视频追踪数据及特征提取结果,是C.elegans行为数据库的一部分。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:N2 on food R_2011_06_09__11_52_54__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含26797个分割骨架信息,对应899秒实验时长、30.03帧/秒的采样频率。
- 特征数据文件
- 文件名称:N2 on food R_2011_06_09__11_52_54__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,基于原始追踪数据生成。
- 压缩数据文件
- 文件名称:N2 on food R_2011_06_09__11_52_54__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式封装。
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫行为表型分析:研究N2野生型线虫在标准化环境中的运动模式、觅食行为等表型特征。
- 神经生物学研究:结合行为数据探索线虫神经系统与行为的关联机制。
- 模式生物实验标准化:作为基准数据集验证线虫行为实验的重复性与标准化流程。
- 行为分析算法测试:用于评估tierpsy等行为追踪软件的特征提取精度与算法性能。