数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了NL797品系(gpa-15(pk477)I)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。实验由剑桥MRC分子生物学实验室完成,包含视频跟踪数据及行为特征分析结果,用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 文件名称:
gpa-15 (pk477)I on food L_2009_07_10__16_50_10__17.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的WCON格式压缩文件,记录线虫运动轨迹等原始行为信息
- 文件名称:
gpa-15 (pk477)I on food L_2009_07_10__16_50_10__17_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动、姿态等量化指标
- 文件名称:
gpa-15 (pk477)I on food L_2009_07_10__16_50_10__17.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基础参数(如帧率、像素分辨率)及6304个分割骨架数据,记录线虫身体形态时序变化
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经遗传学研究:分析gpa-15基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为量化分析:利用tierpsy提取的特征数据研究线虫运动模式、觅食行为等
- 行为实验方法学验证:参考标准化实验流程(如30分钟适应期、视频跟踪参数)优化线虫行为实验设计
- 生物信息学工具应用:测试HDF5格式在模式生物行为大数据存储与分析中的适用性