数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1340品系(nlp-1(ok1469)X基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频追踪及特征提取结果,用于研究该基因突变对蠕虫运动行为的影响。
文件详解
- 文件名称:nlp-1 (ok1469)X on food R_2010_03_17__12_55_59610_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的蠕虫行为特征数据,包含骨架分割、运动参数等特征信息
- 文件名称:nlp-1 (ok1469)X on food R_2010_03_17__12_55_59610.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的行为数据文件,记录蠕虫运动轨迹的标准化数据
- 文件名称:nlp-1 (ok1469)X on food R_2010_03_17__12_55_59610.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含898秒视频的25.77帧/秒图像特征、像素-微米映射关系(4.33523微米/像素)及19478个分割骨架数据
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 线虫神经基因功能研究:分析nlp-1基因突变体与野生型线虫的行为表型差异,探究该基因在神经调控中的作用
- 行为表型组学分析:基于标准化行为数据开展线虫运动模式、觅食行为的量化研究
- 基因突变体筛选:作为模式生物行为实验参考数据,支持线虫基因功能的高通量筛选
- 行为追踪算法验证:利用标注的骨架数据和特征文件,验证蠕虫行为追踪软件的准确性与稳定性