数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB1609品系(nlp-5(ok1981)II基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年6月30日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为记录及分析结果,支持线虫基因功能与行为关联的研究。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:nlp-5 (ok1981)II on food L_2009_06_30__10_17__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的原始记录数据,格式遵循wcon标准
- 特征数据文件
- 文件名称:nlp-5 (ok1981)II on food L_2009_06_30__10_17__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,基于tierpsy软件分析生成
- 主数据文件
- 文件名称:nlp-5 (ok1981)II on food L_2009_06_30__10_17__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,涉及6615个分割骨架数据,关联视频像素与实际长度(4.95268微米/像素)的映射关系
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-5基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证E. Yemini等人提出的线虫行为实验方法的可重复性
- 模式生物行为分析: 探究成年雌雄同体线虫在特定培养基上的行为特征
- 基因与行为关联分析: 研究nlp-5基因变异与线虫运动、摄食等行为的相关性
- 实验方法标准化研究: 参考该实验的protocol( habituation时长、培养基类型等)优化线虫行为实验设计