数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了AQ866菌株(基因型ser-4(ok512)III)成年雌雄同体线虫在特定条件下的行为实验数据。包含实验的基本参数、视频信息及处理后的行为特征数据,可用于研究ser-4基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:ser-4 (ok512) on food R_2009_12_14__11_23_4325.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始或核心数据,具体字段未明确说明,推测包含视频帧、线虫轨迹等基础信息
- 行为特征文件
- 文件名称:ser-4 (ok512) on food R_2009_12_14__11_23_4325_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,具体特征字段未明确说明
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ser-4 (ok512) on food R_2009_12_14__11_23_4325.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,wcon格式通常用于存储线虫连续行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ser-4基因(ok512等位基因)对秀丽隐杆线虫行为的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证ser-4基因在秀丽隐杆线虫神经系统中的功能
- 行为学实验方法参考: 参考该实验的protocol(基于E. Yemini等的方法)设计新的线虫行为实验
- 生物信息学工具应用: 利用tierpsy软件对类似线虫行为视频进行特征提取和分析
- 基因与环境互作研究: 结合实验条件(如NGM低蛋白培养基、OP50食物)分析基因与环境对行为的共同影响