数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了snf-6(eg28)III品系成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年10月1日开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物,通过tierpsy软件追踪线虫行为,包含特征数据、原始数据及wcon格式压缩文件三类文件。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:
snf-6 (eg28)III on food R_2010_10_01__13_02_04___1___5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,由tierpsy软件生成,包含运动轨迹、身体姿态等分析特征
- 原始追踪数据文件:
- 文件名称:
snf-6 (eg28)III on food R_2010_10_01__13_02_04___1___5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为原始追踪数据,包含每帧图像的线虫位置、骨架信息等基础数据
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:
snf-6 (eg28)III on food R_2010_10_01__13_02_04___1___5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:wcon格式行为数据的压缩包,wcon为线虫行为数据标准格式,包含时间序列的行为参数
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析snf-6基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 神经生物学实验: 探究线虫行为模式与神经机制的关联
- 模式生物行为学分析: 作为标准化线虫行为实验数据,支持行为表型的比较研究
- 生物信息学算法验证: 用于线虫行为追踪软件的算法优化与结果验证