数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了VC9品系nca-2(gk5)III基因敲除株成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年8月19日开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪线虫行为,包含视频转换数据、特征数据及原始追踪数据,共3个文件。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:nca-2 (gk5)III on food L_2011_08_19__15_43_47811.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的标准化数据,基于wcon格式存储,记录线虫运动轨迹的时间序列信息
- 特征数据文件
- 文件名称:nca-2 (gk5)III on food L_2011_08_19__15_43_47811_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取,包含运动速度、身体弯曲度等行为学特征指标
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:nca-2 (gk5)III on food L_2011_08_19__15_43_47811.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录线虫行为的原始追踪数据,包含26962个分段骨架数据,时间分辨率30.03帧/秒,空间分辨率4.89022微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究:分析nca-2基因敲除对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 基因功能验证:探究nca-2基因在调控线虫运动协调中的作用机制
- 行为学实验方法优化:参考实验方案(如30分钟适应期、tierpsy追踪流程)改进线虫行为实验设计
- 生物行为数据分析算法测试:利用标准化行为数据验证行为特征提取算法的准确性