C_elegans_Based秀丽隐杆线虫egl_18基因行为实验数据2010

数据集概述

本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)JR2370品系(携带egl-18(ok290)IV基因突变)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为特征,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,是研究egl-18基因功能与线虫行为关联的基础数据。

文件详解

  • 行为特征数据文件
  • 文件名称:egl-18 (ok290)IV on food R_2010_07_16__12_25_5127_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:包含线虫运动行为的特征提取结果,涉及骨架分割数据(共19351个分段骨架)、时间参数(总时长约900秒,帧率25.51帧/秒)、空间参数(像素对应微米数4.49333)等行为量化指标
  • 原始追踪数据文件
  • 文件名称:egl-18 (ok290)IV on food R_2010_07_16__12_25_5127.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:存储tierpsy软件追踪得到的线虫行为原始数据,记录实验过程中的动态行为轨迹
  • 标准化格式压缩文件
  • 文件名称:egl-18 (ok290)IV on food R_2010_07_16__12_25_5127.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
  • 字段映射介绍:采用WCON(蠕虫行为数据交换格式)的标准化行为数据压缩包,便于跨平台的数据共享与分析

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫基因功能研究:分析egl-18基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究基因调控机制
  • 模式生物行为学分析:基于标准化行为数据,开展线虫行为模式的量化分析与表型鉴定
  • 神经生物学实验验证:结合实验条件(如NGM培养基、OP50食物源),验证环境因素与基因互作对行为的调控作用
  • 生物信息学工具测试:作为tierpsy等行为追踪软件的验证数据集,评估特征提取算法的准确性
  • 跨实验室数据整合:通过WCON标准化格式,实现不同研究团队线虫行为数据的统一分析与比较
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 248.92 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。