数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了nlp-14(tm1880)X基因突变株成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析线虫运动,包含特征数据、原始追踪数据及wcon格式压缩文件,共三个文件。
文件详解
- 文件1:nlp-14 (tm1880)X on food R_2010_03_12__13_05_0049_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含基于19823个分割骨架提取的运动特征(如速度、弯曲度等),对应实验总时长899.117秒、帧率25.8398帧/秒、像素分辨率4.7068微米/像素。
- 文件2:nlp-14 (tm1880)X on food R_2010_03_12__13_05_0049.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为原始追踪数据,记录实验过程中线虫的位置、骨架等基础追踪信息。
- 文件3:nlp-14 (tm1880)X on food R_2010_03_12__13_05_0049.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩的wcon格式文件,包含线虫行为数据的标准化交换格式内容。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析nlp-14基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用。
- 线虫行为学分析:基于追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为特征。
- 行为实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方案,验证线虫行为实验的标准化流程。
- 生物信息学工具应用:评估tierpsy软件在线虫行为特征提取中的效果与准确性。