数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫AQ1413菌株(携带mec-10基因突变及pmec-4::YC2.12荧光标记)的行为实验数据,属于C.elegans behavioural database的一部分。数据记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包含原始跟踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,用于线虫神经生物学与行为学研究。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:mec-10 (tm1552) on food L_2010_10_21__11_28_05__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始跟踪数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、时间戳等基础信息
- 特征提取文件(.hdf5格式)
- 文件名称:mec-10 (tm1552) on food L_2010_10_21__11_28_05__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等经tierpsy软件提取的量化指标
- 标准化格式文件(.wcon.zip格式)
- 文件名称:mec-10 (tm1552) on food L_2010_10_21__11_28_05__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含WCON格式文件)
- 字段映射介绍:采用WCON标准化格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经突变体行为表型分析: 研究mec-10基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 线虫行为量化方法验证: 基于tierpsy软件提取的特征数据,验证行为分析算法的准确性
- 神经生物学机制研究: 结合荧光标记与行为数据,探究机械感知相关基因对行为的调控机制
- 模式生物行为数据库构建: 作为标准化线虫行为数据,支持大规模行为组学数据库的整合与共享
- 实验方法复现与优化: 参考实验方案(如30分钟适应期、视频采集参数),优化线虫行为实验设计