数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB2005菌株(携带T28F2.7基因ok2657突变)的成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为实验数据,包含实验条件、视频参数及行为特征文件,可用于分析该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:T28F2.7 (ok2657) on food L_2010_03_30__12_28_5485.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为原始追踪数据,如运动轨迹、身体姿态等基础观测信息
- 文件名称:T28F2.7 (ok2657) on food L_2010_03_30__12_28_5485_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含提取的线虫行为特征数据,如速度、弯曲频率、运动模式等量化指标
- 文件名称:T28F2.7 (ok2657) on food L_2010_03_30__12_28_5485.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为数据的标准化交换格式文件,用于行为数据的共享与解析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析T28F2.7基因ok2657突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型分析: 基于追踪数据和特征数据,研究基因突变株的行为模式差异
- 线虫行为实验方法验证: 参考实验方案(E. Yemini等方法),验证类似行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用: 测试和优化tierpsy等线虫行为追踪软件的数据分析效果