数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB668菌株(ftn-2(ok404)I)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪,包含视频及处理后的行为特征数据,可用于线虫行为模式分析。
文件详解
- 文件名称:
ftn-2 (ok404)I on food L_2011_09_15__14_03_34___1___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为追踪的原始或基础数据,如视频帧对应的线虫位置、姿态等原始追踪信息
- 文件名称:
ftn-2 (ok404)I on food L_2011_09_15__14_03_34___1___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化特征
- 文件名称:
ftn-2 (ok404)I on food L_2011_09_15__14_03_34___1___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含WCON格式文件)
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为数据的标准化交换格式文件,可能记录线虫的运动轨迹、行为事件等结构化信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ftn-2基因(ok404突变体)对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 线虫行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 行为分析软件性能评估: 以tierpsy软件提取的特征数据为基础,评估其线虫行为追踪的准确性
- 线虫环境适应性研究: 探究含OP50食物的培养环境下线虫的觅食、运动等行为特征