数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2品系的行为实验数据,来自Schafer Lab。记录了2010年10月15日在英国剑桥MRC分子生物学实验室开展的实验,包含线虫在NGM琼脂培养基上的运动特征数据,采用tierpsy软件追踪分析,是线虫行为学研究的基础数据。
文件详解
- 特征数据文件:N2 on food L_2010_10_15__15_18_00__9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动的特征数据,由tierpsy软件生成,具体字段基于软件标准输出(未提供详细字段映射)
- 行为数据压缩包:N2 on food L_2010_10_15__15_18_00__9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据文件,记录运动轨迹等信息
- 原始追踪数据文件:N2 on food L_2010_10_15__15_18_00__9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动的原始追踪数据,如骨架分段信息等,共26757个分段骨架记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究:分析N2品系线虫的运动模式、行为特征及环境响应
- 生物软件验证:用于验证tierpsy等线虫行为追踪软件的分析效果
- 实验方法复现:基于实验方案(E. Yemini et al.方法)复现线虫行为实验
- 模式生物数据库补充:为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化实验数据支持