数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB1316菌株(携带unc-105(ok1432)II基因突变)的成年雌雄同体线虫在NGM培养基上的行为实验数据,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于分析线虫的运动行为特征。
文件详解
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:unc-105 (ok1432) on food L_2010_04_16__10_37_1421.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,记录实验过程中线虫的运动轨迹等基础信息
- 特征提取数据文件
- 文件名称:unc-105 (ok1432) on food L_2010_04_16__10_37_1421_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于19597个分割骨架计算得到,关联实验参数如帧率(每秒25.5102帧)、像素分辨率(每像素4.1716微米)等
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:unc-105 (ok1432) on food L_2010_04_16__10_37_1421.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,用于标准化数据共享与解析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变表型分析: 研究unc-105基因缺陷对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学机制研究: 分析基因突变线虫的行为特征,探索相关神经调控机制
- 行为学实验方法验证: 基于标准化实验流程(参考E. Yemini等的方法),验证线虫行为学实验的可重复性
- 生物信息学工具开发: 利用标准化数据格式(wcon)测试或优化线虫行为数据分析工具
- 模式生物行为数据库构建: 补充秀丽隐杆线虫行为数据库的实验数据,支持大规模行为学数据整合研究