数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了CB5品系unc-7(e5)X基因变异线虫的行为实验数据。实验于2010年9月9日开展,包含线虫在NGM培养基上的运动行为观测结果,涉及基因、染色体、性别、发育阶段等实验条件及视频追踪数据,共3个相关文件。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:unc-7 (cb5) on food R_2010_09_09__11_45_3666.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫运动坐标、时间序列等基础观测信息
- 特征数据文件
- 文件名称:unc-7 (cb5) on food R_2010_09_09__11_45_3666_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,可能涉及运动速度、身体弯曲度、轨迹模式等量化特征
- 压缩数据文件
- 文件名称:unc-7 (cb5) on food R_2010_09_09__11_45_3666.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录标准化的行为观测结果
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析unc-7基因变异对CB5品系线虫运动行为的影响,探究基因功能与行为表型的关联
- 行为生物学实验:基于视频追踪数据研究线虫在特定培养基(NGM agar low peptone)上的运动模式、速度及轨迹特征
- 实验方法验证:参考实验协议(E. Yemini et al.方法),验证线虫行为观测实验的可重复性与标准化流程
- 生物信息学分析:利用特征数据文件中的量化指标,开展线虫行为特征的统计分析与模式识别研究