数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC1309菌株(nlp-8基因ok1799突变体)的成年雌雄同体线虫在特定条件下的行为实验数据,包含实验参数、视频追踪结果及特征提取文件,用于研究线虫基因功能与行为表型的关联。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:nlp-8 (ok1799) on food R_2010_12_16__12_5532.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、运动轨迹等基础观测信息
- 文件名称:nlp-8 (ok1799) on food R_2010_12_16__12_5532_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储从原始数据中提取的行为特征数据,包含运动速度、身体弯曲度、摆动频率等量化指标
- 文件名称:nlp-8 (ok1799) on food R_2010_12_16__12_5532.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含WCONT格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据交换格式文件,包含标准化的行为时序数据,支持跨平台分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-8基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究神经肽基因的生物学功能
- 行为表型量化分析: 利用提取的行为特征数据,比较突变体与野生型线虫的运动模式差异
- 神经生物学实验复现: 基于实验参数和追踪方法,复现或扩展线虫行为学研究
- 生物数据标准化应用: 采用WCONT格式文件开展跨实验室的线虫行为数据共享与整合分析