数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了VC1340品系(携带C52B9.11(gk596)X基因)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂平板中的行为实验数据,包含视频及分析特征文件,可用于研究该基因相关的线虫行为表型。
文件详解
- 特征文件
- 文件名称:C52B9.11 (gk596)V on food L_2011_08_19__12_4037_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析生成,涉及线虫运动的骨架分割等特征(共21503个分段骨架)
- 行为数据文件
- 文件名称:C52B9.11 (gk596)V on food L_2011_08_19__12_4037.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的核心数据,对应实验的视频分析结果
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:C52B9.11 (gk596)V on food L_2011_08_19__12_4037.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,包含实验相关的结构化行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析C52B9.11基因对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 线虫行为学表型分析: 基于视频及特征数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度等行为参数
- 基因与行为关联研究: 探索特定基因突变(gk596)与线虫行为表型的相关性
- 生物实验标准化方法验证: 参考实验所用的E. Yemini等的方法,验证线虫行为实验的标准化流程