数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了AQ2649品系(携带mec-18(u228)突变及pmec-4::YC2.12转基因标记)成虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据。包含视频追踪原始数据、特征提取结果等,用于研究mec-18基因对线虫行为的影响,实验由剑桥MRC分子生物学实验室完成。
文件详解
- 文件名称:mec-18 (u228) on food L_2010_11_04__11_18_2583.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:线虫行为视频追踪的原始数据压缩包,包含实验过程的视频相关记录
- 文件名称:mec-18 (u228) on food L_2010_11_04__11_18_2583_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征提取结果文件,存储由tierpsy软件分析得到的行为特征数据
- 文件名称:mec-18 (u228) on food L_2010_11_04__11_18_2583.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为实验的核心数据文件,包含26018个分段骨架数据、帧率(30.03帧/秒)、像素微米比(4.52963微米/像素)等实验参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究: 分析mec-18基因对线虫机械感觉相关行为的调控机制
- 线虫行为特征提取: 基于tierpsy软件输出的特征数据,研究线虫运动行为的量化指标
- 基因功能验证: 对比野生型与mec-18突变体线虫的行为差异,验证该基因的功能
- 实验方法复现: 参考E. Yemini等人的实验方法,复现线虫行为学实验流程
- 生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的基因功能实验数据