数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了Schafer实验室2012年8月开展的N2品系(布里斯托尔株)成虫雌雄同体的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基上进行,经30分钟适应后录制视频,通过Tierpsy软件提取运动特征,包含原始视频处理文件及特征数据。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:N2 on food L_2012_08_31__14_34_41412.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始处理数据,包含视频帧对应的线虫形态、位置等基础信息
- 特征数据文件
- 文件名称:N2 on food L_2012_08_31__14_34_41412_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含26945个分段骨架数据,记录线虫运动的特征参数(如身体弯曲度、运动速度等)
- 压缩数据文件
- 文件名称:N2 on food L_2012_08_31__14_34_41412.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,可能包含标准化格式的运动轨迹信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为模式研究: 分析N2品系在食物环境中的运动轨迹、身体姿态变化等行为特征
- 神经生物学实验验证: 结合实验条件(如培养基、食物类型)研究线虫行为与环境的响应关系
- 行为分析软件校准: 利用已知品系的行为数据验证Tierpsy等运动追踪软件的准确性
- 模式生物标准化实验参考: 为秀丽隐杆线虫行为实验提供标准化的实验设计(如适应时间、录制参数)及数据格式参考