数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB919品系(携带snf-1(ok790)I基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在特定培养条件下进行,包含视频记录及处理后的行为特征数据,可用于研究snf-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food R_2009_11_18__15_54_01212_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,具体字段基于tierpsy软件分析结果(如运动轨迹、身体姿态等特征)
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food R_2009_11_18__15_54_01212.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含wcon格式的线虫行为数据文件,记录线虫行为的时间序列信息
- 核心数据文件
- 文件名称:snf-1 (ok790)I on food R_2009_11_18__15_54_01212.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,如视频帧解析后的线虫骨架数据(共19507个分段骨架)、时间戳等基础信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析snf-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 线虫行为学分析: 基于视频解析数据研究线虫在特定培养基上的行为模式
- 模式生物实验方法验证: 参考实验方案(如30分钟适应期、视频录制参数)优化线虫行为实验设计
- 生物信息学工具应用: 验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为特征提取中的效果