数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了DH244品系(携带zyg-9(b244)II突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2012年3月15日开展,通过视频追踪获取线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的运动特征,包含原始追踪、特征提取及标准化格式的三类文件。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:zyg-9 (b244)II on food L_2012_03_15__10_52_0115.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含25167个分割骨架信息,对应实验总时长899秒、帧率30.03帧/秒的视频记录
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:zyg-9 (b244)II on food L_2012_03_15__10_52_0115_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含基于视频像素(4.51738微米/像素)转换的运动学参数
- 标准化格式文件(.zip格式)
- 文件名称:zyg-9 (b244)II on food L_2012_03_15__10_52_0115.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含符合wcon标准格式的线虫行为数据压缩包,便于跨平台数据交换与分析
数据来源
MRC Laboratory of Molecular Biology(英国剑桥)
适用场景
- 基因功能研究:分析zyg-9基因突变对线虫运动行为的影响
- 线虫行为学分析:基于追踪数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度及轨迹特征
- 生物信息学工具验证:用于测试或优化tierpsy等线虫行为追踪软件的算法性能
- 模式生物数据库补充:作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析