数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2010年5月14日开展的MT1222品系(携带egl-6(n592)X突变)线虫的行为实验数据。实验通过tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的行为,包含视频处理后的骨架分割、特征提取等结果,支持线虫基因功能与行为表型关联分析。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:egl-6 (n592)X on food L_2010_05_14__12_10_2327.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始处理数据,包含视频帧对应的骨架分割信息(共19467个分割骨架)、时间戳等基础数据
- 行为特征文件
- 文件名称:egl-6 (n592)X on food L_2010_05_14__12_10_2327_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含从视频中提取的线虫行为特征数据,结合tierpsy软件的特征定义,记录线虫运动、姿态等量化指标
- 压缩数据文件
- 文件名称:egl-6 (n592)X on food L_2010_05_14__12_10_2327.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,格式遵循wcon标准,包含线虫行为的时间序列信息
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析egl-6基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为学特征提取验证:基于tierpsy软件的输出数据,验证线虫行为特征提取算法的有效性
- 线虫行为表型关联分析:结合基因背景与行为数据,探究基因与行为表型的关联机制
- 模式生物实验方法参考:为秀丽隐杆线虫行为学实验的设计、数据采集与处理提供方法学参考