数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2010年1月26日在英国剑桥MRC分子生物学实验室Schafer Lab开展的N2菌株(布里斯托尔品系)成虫雌雄同体的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析线虫行为,包含原始追踪、特征提取及标准化格式的三类文件。
文件详解
- 文件名称:N2 on food L_2010_01_26__10_44_4581.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,可能涉及视频帧、骨架分割等基础行为记录
- 文件名称:N2 on food L_2010_01_26__10_44_4581.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化行为数据压缩包,遵循wcon格式规范存储线虫行为时序信息
- 文件名称:N2 on food L_2010_01_26__10_44_4581_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征提取结果,包含基于tierpsy软件分析得到的线虫运动、姿态等特征参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 秀丽隐杆线虫行为模式研究: 分析N2野生型菌株在食物环境中的运动轨迹、姿态变化等基础行为特征
- 行为学实验方法验证: 基于已发表的Yemini等实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 行为数据分析工具评估: 以tierpsy软件提取的特征数据为基础,评估线虫行为分析工具的性能
- 模式生物行为数据库补充: 作为公共线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为数据的整合与比较研究