数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,记录了品系AQ2934[nca-2(gk5);nzIs29]成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年11月11日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为记录,涉及基因、染色体、培养条件、实验参数及行为特征数据,共3个文件。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:nca-2 (gk5) nRHO-1 QT309 on food R_2011_11_11__12_14_4061_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,可能包含运动轨迹、身体姿态、速度等由tierpsy软件提取的特征参数
- 实验主数据文件:
- 文件名称:nca-2 (gk5) nRHO-1 QT309 on food R_2011_11_11__12_14_4061.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,可能包含原始图像分析结果、时间序列数据及实验元数据关联信息
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:nca-2 (gk5) nRHO-1 QT309 on food R_2011_11_11__12_14_4061.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据,可能包含符合WCON格式的行为记录文件
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析nca-2、rho-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 线虫行为学实验方法验证:基于E. Yemini等的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 基因编辑品系表型分析:研究基因编辑品系AQ2934的行为表型特征与野生型的差异
- 线虫行为特征提取算法测试:以本数据为样本,测试tierpsy等行为分析软件的特征提取准确性
- 环境因素对蠕虫行为影响研究:分析NGM低蛋白胨培养基、OP50食物等环境条件对线虫行为的影响