数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2009年7月JT603菌株(gpb-2(sa603)I基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的行为实验数据,包含视频跟踪所得的运动特征和行为参数,用于研究gpb-2基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(共3个)
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2009_07_16__15_10_42__6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩包,记录线虫运动轨迹相关信息
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2009_07_16__15_10_42__6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征参数
- 文件名称:gpb-2 (sa603) on food L_2009_07_16__15_10_42__6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始跟踪数据,包含6000个分割骨架等运动相关信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 模式生物基因功能研究: 分析gpb-2基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 生物行为学实验复现: 基于标准化实验参数(如培养条件、跟踪方法)复现线虫行为实验
- 行为特征提取算法验证: 利用已知基因背景的线虫行为数据,验证tierpsy等跟踪软件的特征提取准确性
- 基因-行为关联分析: 结合基因突变信息与运动参数,探究gpb-2基因功能与线虫行为表型的关联机制