C_elegans_KU25品系pmk_1基因行为实验数据2010

数据集概述

本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了KU25品系(pmk-1(km25)IV基因突变体)成年雌雄同体在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据。实验于2010年4月23日开展,使用tierpsy软件采集并分析,包含视频原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,共3个文件。

文件详解

  • 文件1:pmk-1 (km25)on food L_2010_04_23__11_57_27___6___7.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:包含实验原始视频数据及基础记录信息,如帧率(25.641帧/秒)、像素-微米转换系数(4.33523微米/像素)、总时长(898.131秒)等
  • 文件2:pmk-1 (km25)on food L_2010_04_23__11_57_27___6___7_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取数据,如17733个分割骨架的形态、运动轨迹等行为参数
  • 文件3:pmk-1 (km25)on food L_2010_04_23__11_57_27___6___7.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
  • 字段映射介绍:以标准化wcon格式存储的线虫行为数据压缩包,用于跨平台数据共享与分析

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫基因功能研究:分析pmk-1基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
  • 行为表型分析:通过骨架分割及特征数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、轨迹及节律
  • 实验方法验证:基于标准化实验协议,验证线虫行为实验的可重复性与数据采集工具的可靠性
  • 生物信息学工具测试:用于评估tierpsy等线虫行为分析软件的性能与特征提取准确性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 399.9 MiB
最后更新 2026年1月27日
创建于 2026年1月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。