数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了KU25品系(pmk-1(km25)IV基因突变体)成年雌雄同体在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据。实验于2010年4月23日开展,使用tierpsy软件采集并分析,包含视频原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,共3个文件。
文件详解
- 文件1:
pmk-1 (km25)on food L_2010_04_23__11_57_27___6___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始视频数据及基础记录信息,如帧率(25.641帧/秒)、像素-微米转换系数(4.33523微米/像素)、总时长(898.131秒)等
- 文件2:
pmk-1 (km25)on food L_2010_04_23__11_57_27___6___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取数据,如17733个分割骨架的形态、运动轨迹等行为参数
- 文件3:
pmk-1 (km25)on food L_2010_04_23__11_57_27___6___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:以标准化wcon格式存储的线虫行为数据压缩包,用于跨平台数据共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析pmk-1基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型分析:通过骨架分割及特征数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、轨迹及节律
- 实验方法验证:基于标准化实验协议,验证线虫行为实验的可重复性与数据采集工具的可靠性
- 生物信息学工具测试:用于评估tierpsy等线虫行为分析软件的性能与特征提取准确性