数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB1372品系(nlp-18基因ok1557突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频追踪的原始数据、特征数据及标准化格式数据,可用于线虫行为模式分析。
文件详解
- 行为追踪原始数据文件
- 文件名称:nlp-18 (ok1557)II on food R_2010_03_12__12_0437.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、运动轨迹等基础观测信息
- 行为特征提取数据文件
- 文件名称:nlp-18 (ok1557)II on food R_2010_03_12__12_0437_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动速度、身体弯曲度等量化指标
- 标准化行为数据压缩包
- 文件名称:nlp-18 (ok1557)II on food R_2010_03_12__12_0437.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的标准化线虫行为数据,用于跨平台的行为数据共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-18基因ok1557突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为学实验方法验证: 基于tierpsy软件的追踪数据,验证线虫行为观测实验的标准化流程
- 线虫行为特征分析: 利用特征数据研究线虫在食物环境中的运动轨迹、速度等行为参数
- 生物数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持线虫行为组学的整合研究