数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了NL335品系(gpa-3(pk35)V)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,使用tierpsy软件追踪,包含视频衍生的行为特征数据,可用于分析gpa-3基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:gpa-3 (pk35)IV on food R_2010_03_04__11_42_5019.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的WCON格式压缩数据,记录运动轨迹的时序信息
- 核心行为数据文件
- 文件名称:gpa-3 (pk35)IV on food R_2010_03_04__11_42_5019.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始结构化数据,包含19575个分割骨骼数据,记录运动姿态的空间坐标及时序变化
- 行为特征数据文件
- 文件名称:gpa-3 (pk35)IV on food R_2010_03_04__11_42_5019_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,关联实验参数(如帧率25.8398帧/秒、像素分辨率4.29558微米/像素)及运动特征指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-3基因(pk35等位基因)对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 模式生物行为学分析: 利用轨迹和特征数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度及姿态变化
- 神经生物学机制探索: 结合基因背景探究G蛋白信号通路对行为的影响
- 行为追踪技术验证: 基于tierpsy软件的输出数据,评估模式生物行为自动追踪的准确性与可靠性