数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了NL1142品系(携带gpa-8(pk345)V基因突变)成虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据。实验于2010年3月11日开展,包含视频追踪记录及行为特征分析结果,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:gpa-8 (pk345)V on food R_2010_03_11__10_23_1912.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含实验的原始行为数据压缩包,具体内容需解压后查看
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-8 (pk345)V on food R_2010_03_11__10_23_1912_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析生成
- 主数据文件
- 文件名称:gpa-8 (pk345)V on food R_2010_03_11__10_23_1912.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的核心数据,涵盖视频追踪参数(如帧率、像素与微米转换比)、线虫骨架分割数据(共19360个分割骨架)等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-8(pk345)V基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为学实验方法验证: 基于标准化实验协议(E. Yemini et al.方法),验证线虫行为实验的可重复性
- 生物图像分析算法测试: 利用tierpsy软件生成的特征数据,测试或优化线虫行为特征提取算法
- 神经生物学研究: 结合线虫基因背景与行为数据,探索神经系统调控行为的分子机制