数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了2009年6月2日开展的AQ495品系(携带gpa-14(pk347)I突变)线虫的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪线虫行为,包含行为特征、运动轨迹等数据文件,可用于研究gpa-14基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__14_34__16_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,由tierpsy软件生成,具体特征字段未详细说明。
- 运动轨迹压缩文件
- 文件名称:gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__14_34__16.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含线虫运动轨迹数据,格式为wcon(线虫行为数据标准格式)。
- 核心实验数据文件
- 文件名称:gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__14_34__16.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,如线虫骨架分割信息(共6345个分割骨架)、时间参数(总时长299.88秒、帧率31.746帧/秒)、空间参数(像素对应微米数4.95268)等。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gpa-14基因突变对线虫行为模式的影响。
- 生物行为学实验验证:验证特定基因(如gpa-14)与线虫运动、觅食等行为的关联。
- 行为追踪技术应用:评估tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为数据采集与分析中的效果。
- 模式生物实验标准化:为秀丽隐杆线虫行为实验的设计、数据采集与存储提供参考案例。