数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)flp-3基因(allele ok3265)突变株(VC2497)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为特征,包含实验参数、视频追踪数据及特征提取结果,可用于研究flp-3基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:flp-3 (ok3265) on food R_2011_02_08__12_14_5515.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始追踪数据,可能涵盖时间序列、运动轨迹等基础观测信息
- 特征提取文件
- 文件名称:flp-3 (ok3265) on food R_2011_02_08__12_14_5515_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含26459个分段骨架等运动特征参数
- 压缩数据文件
- 文件名称:flp-3 (ok3265) on food R_2011_02_08__12_14_5515.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式存储的线虫行为数据文件,可能包含标准化的运动数据记录
数据来源
线虫行为数据库(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析flp-3基因(ok3265等位基因)对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 线虫行为学分析: 研究特定培养条件下(NGM低蛋白胨培养基、OP50食物源)线虫的运动模式、速度及轨迹特征
- 行为实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用: 评估tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为特征提取中的效果与准确性
- 神经生物学研究: 探索神经肽基因flp-3在秀丽隐杆线虫神经系统中的功能及作用机制