数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)MT1236品系(egl-40(n606)IV基因突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含实验参数、视频跟踪数据及行为特征提取结果,支持线虫基因功能与行为关联性研究。
文件详解
- 核心数据文件(HDF5格式)
- 文件名称:
egl-40 (n606)IV on food L_2010_09_16__11_47_42__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始跟踪数据,包含26570个分段骨架信息,对应898.967秒实验时长内的行为记录
- 特征数据文件(HDF5格式)
- 文件名称:
egl-40 (n606)IV on food L_2010_09_16__11_47_42__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,基于每秒30.03帧的视频数据生成
- 行为数据压缩文件(ZIP格式)
- 文件名称:
egl-40 (n606)IV on food L_2010_09_16__11_47_42__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩包,视频像素分辨率为4.56732微米/像素
数据来源
线虫行为数据库(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析egl-40基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 线虫行为学分析:基于跟踪数据研究线虫在食物环境中的运动特征、行为节律
- 基因突变体表型分析:对比野生型与egl-40(n606)突变体的行为差异
- 行为实验方法验证:参考标准化实验方案(E. Yemini等人方法)优化线虫行为学实验设计
- 生物信息学工具应用:验证tierpsy软件在线虫行为特征提取中的有效性