数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫npr-10(tm1568)突变体的行为实验记录,包含在NGM低蛋白胨培养基上、以OP50为食物的成年雌雄同体线虫的运动行为数据,记录时间约九百秒,由MRC分子生物学实验室Schafer团队使用Tierpsy软件采集分析,是线虫神经生物学研究的基础数据。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:npr-10 (tm1568) on food L_2010_01_25__14_2335_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动行为的特征数据,基于17988个分割骨架提取,对应20帧/秒的视频采样
- 实验原始数据文件
- 文件名称:npr-10 (tm1568) on food L_2010_01_25__14_2335.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始数据,关联视频分辨率(4.37177微米/像素)、总时长(899.35秒)等基础参数
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:npr-10 (tm1568) on food L_2010_01_25__14_2335.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,遵循WCON数据格式标准
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经基因功能研究: 分析npr-10基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 行为表型分析: 基于骨架分割数据研究突变体线虫的运动模式、速度及轨迹特征
- 神经生物学实验方法验证: 参考Tierpsy软件的采样分析流程,优化线虫行为实验方案
- 基因-行为关联研究: 对比野生型与突变体线虫的行为差异,探究npr-10基因的生物学功能