数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,记录了PS4330菌株(基因型spe-41(sy693)III; him-5(e1490)V)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年7月8日在英国MRC分子生物学实验室完成,包含线虫在NGM培养基上的行为观测记录及分析结果,共3个数据文件。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:
spe-41 (sy693); hin-5 (e1490) on food L_2010_07_08__15_14_37___4___9.hdf5、spe-41 (sy693); hin-5 (e1490) on food L_2010_07_08__15_14_37___4___9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为观测的原始数据与特征数据,涉及19077个分段骨架数据,关联实验参数如帧率(每秒26.178帧)、视频像素分辨率(每像素4.59377微米)、总时长(897.853秒)等
- 归档文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:
spe-41 (sy693); hin-5 (e1490) on food L_2010_07_08__15_14_37___4___9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:WCON格式行为数据的压缩包,用于存储线虫行为轨迹的标准化数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析him-5、spe-41基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析: 基于分段骨架数据研究线虫运动模式、觅食行为等特征
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等提出的实验方法,验证线虫行为观测的标准化流程
- 生命科学数据整合: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持多实验数据的交叉分析