数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2品系的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。实验由Schafer实验室开展,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的运动行为,包含原始视频追踪数据及处理后的特征数据,共3个文件。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:N2 on food R_2010_10_28__10_54_3211.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含24832个分段骨架信息,对应899秒实验时长内的运动轨迹记录
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:N2 on food R_2010_10_28__10_54_3211_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储处理后的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件提取的运动参数
- 压缩数据文件(.zip格式)
- 文件名称:N2 on food R_2010_10_28__10_54_3211.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式封装
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究: 分析N2品系线虫在食物环境中的运动模式、轨迹特征及行为节律
- 生物实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为观测的标准化流程
- 行为特征提取算法测试: 利用已知行为数据评估tierpsy等追踪软件的特征提取效果
- 模式生物数据库补充: 为线虫行为数据库提供标准化的实验数据,支持跨实验室数据比对